平静的一天，警局却突然出现了大骚动。原来古畑任三郎（田村正和饰）下落不明，引来各方恐慌与猜测。据古畑刑警的好搭档今泉慎太郎（西村雅彦饰）的描述，古畑在解决完二叶凤翠（山口智子饰）的案件后（SPしばしのお別れ），只身前往别庄，也就是漫画家小石川千波（中森明菜饰）的别墅（第一回死者からの伝言），从此便消失无踪。为了查明真相，警方调查了小石川千奈美、中村右近（堺正章饰）、黑田清（石黒賢饰）等所有古畑抓获过的犯人，他们有的对古畑感恩有加，有的对其愤恨不已，然而却始终找不到丝毫有用的线索。最终的结果却令人捏了一把汗……本片为1996年上映的总集篇。
《古畑任三郎SP3消失的名侦探》这部悬疑片带来了一个扣人心弦的故事。一天，古畑任三郎突然下落不明，引发了警局的恐慌和猜测。他最后一次出现是在解决了二叶凤翠的案件后，前往别庄，也就是漫画家小石川千波的别墅。然而，自那之后，古畑就消失得无影无踪。
为了揭开古畑的失踪之谜，警方展开了一系列调查工作。他们审讯了古畑曾经抓获过的犯人，包括小石川千奈美、中村右近和黑田清等人。这些犯人对古畑有着不同的情感，有的感激他，有的对他怀恨在心。然而，所有的调查都没有发现任何有用的线索。
案件的发展充满了紧张和悬疑。观众们随着剧情的推进，紧张地寻找着古畑的下落和真相。古畑的消失是一场谜团，而解开这个谜团的关键在于隐藏在案件背后的秘密。
《古畑任三郎SP3消失的名侦探》展示了古畑和他的团队在面临困境时的智慧和勇气。今泉慎太郎作为古畑的搭档，努力寻找线索，解开迷团。观众将见证他们面对各种困难和挑战的过程，以及他们如何运用推理和洞察力逐渐接近真相。
这部电影不仅仅是一部悬疑片，也是一场关于友谊和忠诚的故事。古畑的消失让他的搭档和朋友们意识到他们对他的重要性，他们团结一心，决心找到他并解开谜团。